Ακόμα ένας εμβληματικός ναός, ο οποίος μετά τον Άγιο Θεράποντα χρήζει άμεσης παρέμβασης και συντήρησης εξωτερικά είναι η Μητρόπολη Μυτιλήνης, καθώς τα προβλήματα που υπάρχουν πέρα από το γεγονός ότι δημιουργούν μια εικόνα η οποία δεν θα έπρεπε να υπάρχει για την εκκλησία αναδεικνύουν και σοβαρά ζητήματα στη λειτουργία της. Αν και έχουν γίνει κάποιες πρώτες εργασίες, εντούτοις λόγω της παλαιότητας του κτιρίου παραμένουν τα προβλήματα οδηγώντας τους ιερείς και τους πιστούς να απευθύνουν έκκληση για την αντιμετώπισή τους.
Πιο συγκεκριμένα λόγω της παλαιότητας του ναού και λόγω της υγρασίας έχουν δημιουργηθεί πολλά προβλήματα στα κουφώματα και στα παράθυρα της εκκλησίας. Σε αρκετά σημεία μάλιστα η σκουριά έχει αλλοιώσει σημεία των παραθύρων, με αποτέλεσμα, μετά από μία βροχή, να μπαίνει νερό μέσα στην εκκλησία. Οι ιερείς, αλλά και αρκετοί πιστοί αναγκάζονται να μαζεύουν τα νερά με τους κουβάδες. Και μιλάμε για την Μητρόπολη Μυτιλήνης, μια από τις κεντρικές και πολυσύχναστες εκκλησίες, η οποία πλημμυρίζει από κόσμο κάθε φορά που έχει λειτουργία, που μαζί με τον Άγιο Θεράποντα αποτελούν δύο εμβληματικά μνημεία, τα οποία καθημερινά δέχονται επισκέψεις από Τούρκους τουρίστες κι όχι μόνο.
Σε αυτό το σημείο να επισημάνουμε ότι προβλήματα υπήρχαν λόγω απουσίας συντήρησης σε όλες τις πλευρές περιμετρικά του ναού. Παρόλα αυτά είχαν γίνει κάποιες παρεμβάσεις (αλλαγές σε παράθυρα όπου τοποθετήθηκαν καινούργια) σε ορισμένες από τις πλευρές του ναού, αφήνοντας την κεντρική εμπρόσθια όψη εκτεθειμένη με τα προβλήματά της. Και επειδή είχαν εντοπιστεί παρόμοια προβλήματα και στον Άγιο Θεράποντα – εκεί όμως η έναρξη των εργασιών ήταν άμεση – είναι λογικό και επόμενο κάτι τέτοιο να πρέπει να γίνει και για την Μητρόπολη.
Μιλώντας στα Νέα της Λέσβου ο Αντιπεριφερειάρχης Τεχνικών Έργων Τόμμυς Χατζηκυριαζής ανέφερε: «Το ενδιαφέρον του Περιφερειάρχη και της Περιφερειακής μας αρχής για τα θέματα συντήρησης και των θρησκευτικών μνημείων είναι δεδομένο και το έχουμε αποδείξει και μέσα από το έργο αντικατάστασης των κουφωμάτων του Μητροπολιτικού Ναού. Βρίσκομαι πολύ μικρό διάστημα στη θέση του Αντιπεριφερειάρχη με αρμοδιότητα αυτά τα έργα, καταβάλλοντας προσπάθεια για να οργανώσουμε καλύτερα και να αντιμετωπίσουμε τις όποιες αρρυθμίες, όπως εν προκειμένω με τη Μητρόπολη, όπου έληξε η προγραμματική σύμβαση και θα προχωρήσουμε άμεσα σε νέα. Καταλαβαίνω και τη δική σας αγωνία για το Μητροπολιτικό ναό, όπως επίσης και της εκκλησίας και του σεβασμιώτατου Μητροπολίτου Ιακώβου και θέλω να είμαι καθησυχαστικός, διαβεβαιώνοντας ότι σύντομα θα προχωρήσουμε στη δεύτερη και τελική φάση για να ολοκληρώσουμε την παρέμβαση αντικατάστασης του συνόλου των παλιών κουφωμάτων για την οποία αναλάβαμε τη δέσμευση».